Similarité moléculaire et criblage virtuel. Méthodes de recherche in silico d'analogues actifs pour la découverte de composés thérapeutiques

Le « paradigme de similitude », actuellement employé par les chimistes médicinaux pour concevoir des analogues d’un composé actif connu, impliquant une similitude de propriété sur la base d’une parenté structurale, est en fait une loi statistique : la densité des actifs dans une collection de molécules qui sont identiques à une tête de série active surpassera la densité des actifs dans une collection de molécules choisies aléatoirement – si la définition actuelle de « similarité moléculaire » est valable. Dans le contexte de la chimie combinatoire et du criblage à haut débit, les recherches basées sur la similarité in silico reposent sur des descripteurs moléculaires et des métriques de similarité pour sélectionner des analogues de composés actifs à partir d’énormes bases de données électroniques moléculaires.
Cet article est un bref examen de la méthode de recherche de similarité à haut débit, et propose un exemple comparatif concret de la capacité de différents descripteurs et métriques de similarité à récupérer des analogues actifs à partir d’une librairie.